Die Internationale Scienceolympiaden sind die großen Geschwister der IJSO. Hier werden besonders begabte Schülerinnen und Schüler angesprochen, welche sich mit Themen und Experimenten auseinandersetzen wollen, die über das Abiturniveau hinausgehen. Auch hier ist das Ziel, in einem vierstufigen Auswahlwettbewerb das Nationalteam zu erreichen und sich dann mit Jugendlichen international in einer „Olympiade“ zu vergleichen. Die Austragungsorte sind sehr unterschiedlich. So findet z.B. die 32. Biologie Olympiade (2021) in Lissabon statt.
Sie werden für die Bereiche Biologie (IBO), Chemie (IChO) und Physik (IPO) angeboten. Aufgrund des hohen fachlichen Niveaus und des notwendigen Engagements bei der Bearbeitung der Aufgaben, Experimente und Klausuren ist dies auch ein Aushängeschild bei Bewerbungen.
Das Canisianum nimmt jedes Jahr mit einer Gruppe an mindestens einer der Scienceolympiaden teil. Und dies in den letzten Jahren zunehmend erfolgreich. So waren im Jahr 2019 von den angetretenen Teilnehmern bei der Internationalen BiologieOlympiade 5 unter den besten 40 und gleichzeitig die Teilnehmerstärkste Gruppe in NRW.